基本玩法
今彩539是一種樂透型遊戲，您必須從01~39的號碼中任選5個號碼進行投注。開獎時，開獎單位將隨機開出五個號碼，這一組號碼就是該期今彩539的中獎號碼，也稱為「獎號」。您的五個選號中，如有二個以上（含二個號碼）對中當期開出之五個號碼，即為中獎，並可依規定兌領獎金。各獎項的中獎方式如下表：
| 獎項 | 中獎方式 | 中獎方式圖示 |
| 頭獎 | 與當期五個中獎號碼完全相同者 |      |
| 貳獎 | 對中當期獎號之其中任四碼 |     |
| 參獎 | 對中當期獎號之其中任三碼 |    tfoneadtf |
| 肆獎 | 對中當期獎號之其中任二碼 |   |
頭獎中獎率約1/58萬，總中獎率約1/9
獎金分配方式
- 今彩539所有獎項皆為固定獎項，各獎項金額如下：
| 獎項 | 頭獎 | 貳獎 | 參獎 | 肆獎 |
| 單注獎金 | $8,000,000 | $20,000 | $300 | $50 |
- 頭獎至肆獎皆採固定獎金之方式分配之，惟如頭獎中獎注數過多，致使頭獎總額超過新臺幣2,400萬元時，頭獎獎額之獎金分配方式將改為均分制，由所有頭獎中獎人依其中獎注數均分新臺幣2,400萬元〈計算至元為止，元以下無條件捨去。該捨去部分所產生之款項將視為逾期未兌領獎金，全數歸入公益彩券盈餘〉。
投注方式及進階玩法
您可以利用以下三種方式投注今彩539：一、使用選號單進行投注：每張今彩539最多可劃記6組選號，每個選號區都設有39個號碼(01~39)，您可以依照自己的喜好，自由選用以下幾種不同的方式填寫選號單，進行投注。* 注意，在同一張選號單上，各選號區可分別採用不同的投注方式。選號單之正確劃記方式有三種，塗滿
、打叉
，但請勿超過格線。填寫步驟如下：1.劃記選號A.自行選號 在選號區中，自行從01~39的號碼中填選5個號碼進行投注。
B.全部快選
在選號區中，劃記「快選」，投注機將隨機產生一組5個號碼。
C.部分快選
您也可以在選號區中選擇1~4個號碼，並劃記「快選」，投注機將隨機為你選出剩下的號碼，產生一組5個號碼。 以下圖為例，如果您只選擇3、16、18、37 等四個號碼，並劃記「快選」，剩下一個號碼將由投注機隨機快選產生。
